Управление Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору по Чеченской Республике является территориальным органом Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору, осуществляющим функции по контролю и надзору в сфере ветеринарии, карантина и защиты растений, использования пестицидов и агрохимикатов, обеспечения плодородия почв, семеноводства сельскохозяйственных растений, обеспечения качества и безопасности зерна, крупы, комбикормов и компонентов для их производства, побочных продуктов переработки зерна, земельных отношений (в части касающихся земель сельскохозяйственного назначения), функции по защите населения от болезней, общих для человека и животных на территории Чеченской Республики.

Управление в своей деятельности руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, международными договорами Российской Федерации, нормативными правовыми актами Министерства сельского хозяйства Российской Федерации,  Положением о Федеральной службе по ветеринарному и фитосанитарному надзору, приказами и указаниями Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору.

Управление осуществляет возложенные на него полномочия непосредственно и во взаимодействии с другими территориальными органами Россельхознадзора,  полномочным представителем Президента Российской Федерации в Северо-Кавказском  федеральном округе, территориальными органами других федеральных органов исполнительной власти, органами исполнительной власти Чеченской Республики, органами местного самоуправления, общественными объединениями, организациями и гражданами.